Bacillus, çubuk ya da çomak şekilli, gram pozitif ve sporlu bir bakteri cinsidir. Bacillaceae familyasına dahildir. Sporları ısıya dayanıklıdır. Havada suda tozlarda dışkıda ve genellikle toprakta bulunur. Bacillus türleri zorunlu aerob veya fakültatif anaerob'durlar. Kültürde gelişen türleri oksijen varlığında katalaz pozitiftirler.[2] Cinsi tanımlayan "Bacillus" ve sınıfı tanımlayan "Bacilli" bilimsel ve Latince özel adlardır ve gerek İngilizce, gerekse Türkçe metinlerde baş harfleri büyük olarak yazılırlar. Ayrıca, cinsi ve o cinse ait türleri tanımlayan tüm diğer terimlerde olduğu gibi, "Bacillus" da italik yazılır. Mikrobiyoloji ile ilgili İngilizce metinlerdeki cümleler içinde "bacillus" (italik değil, baş harfi küçük) ve "bacilli" (baş harfi küçük) sözcüklerinin yer aldığı görülür: "bacillus", çomak yapılı bakterileri genel anlamda tanımlamak için kullanılan, tekil bir sözcüktür ve Türkçede "basil" olarak geçer; "bacilli" ise "bacillus" sözcüğünün çoğuludur ve Türkçede "basiller" olarak geçer. "Bacillus" adının Türkçedeki okunuşu "basillus" şeklindedir.
Bacillus spp.' nin Bakteriosin Üretimi
Bacillus olarak tanımlanan 114 izolat ve test bakterileri (Escherichia coli, Micrococcus luteus, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumonii, Klebsiella pneumoniae) nutrient broth besi ortamında, 37°C de 24 saat süre ile aktifleştirilmiştir. Bakteriosin üreten izolatların belirlenmesi için izolatlar % 3 glikoz içeren nutrient broth besiyerinde 37°C de 72 saat inkübe edilmiştir. Süre sonunda bakteriler tarafından üretilen antimikrobiyal maddeler 1:3 w/v etil asetatla 3 defa ekstrakte edilmiştir [14,15]. Rotary evaporatörde 1 ml kalıncaya kadar buharlaştırıldıktan sonra 11 mm çapındaki steril filtre kağıtlarına 100 µl emdirilmiştir. Ekstraktların antimikrobiyal aktivitesi test mikroorganizmaları ile belirlenmiştir. Yukarıda belirtildiği şekilde hazırlanan diskler, test bakterilerinin aşılandığı [16] petri kutularına uygun aralıklarla yerleştirilmiştir. Ön inkübasyondan sonra 37°C de 24 saat inkübe edilmiş ve süre sonunda oluşan inhibisyon zonları mm olarak ölçülmüştür [13,14]. Çalışma 3 paralel olarak yürütülmüş ve sonuçlar ortalama değer olarak verilmiştir. 60
Ekstraksiyonu Antibakteriyel madde ürettiği belirlenen 4 Bacillus izolatından Favorgen Favorprep Plasmid DNA Extraction Mini Kit ile plazmitler saflaştırılmıştır. Elde edilen ürünler -20°C de saklanmıştır.
Bulgular ve Tartışma
Gaziantep ili Oğuzeli ilçesinden Hordeum sp. ve Vicia sp. ekilmiş topraklardan Bacillus sp. izole edilmiş ve tanımlaması yapılmıştır. Toprak örneklerinden 121 adet Bacillus suşları izole edilmiştir. İzolatların 114 tanesinin Bacillus genusuna özel 16S rRNA primerleriyle PZR ürünü verdiği tespit edilmiştir.